Атлантический филиал ВНИРО провел консультации с проектными и судоремонтными организациями для подготовки предложений по модернизации НИС «Атлантниро». На сегодняшний день практически все научные исследования в морских и океанических районах, за которые отвечает Атлантический филиал Всероссийского НИИ рыбного хозяйства и океанографии (ВНИРО), выполняются с помощью среднетоннажных судов проекта 833 «Атлантида» и «Атлантниро», построенных в 1987 г. Но если на СТМ «Атлантида» в 2004 г. были установлены новые главные двигатели, а в 2012 г. — вспомогательные дизель-генераторы, отвечающие современным техническим, санитарным и экологическим требованиям, то на его собрате «Атлантниро» таких замен не проводилось.