Отбором проектов для получения инвестиционных квот вылова занимается специальная комиссия. Росрыболовство предлагает обеспечить возможность заочного участия в ее заседаниях. Это объясняется скоростью работы. Уведомление о подготовке проекта изменений порядка работы комиссии и рабочей группы по инвестквотам размещено на портале regulation.gov.ru. В качестве разработчика указано Федеральное агентство по рыболовству.