Сегодня ВНИРО включает 28 филиалов во всех рыбохозяйственных бассейнах страны с общим штатом свыше 5 тысяч человек, из которых 596 кандидатов наук, 102 доктора наук и 31 профессор. Благодаря объединению имущественного комплекса была сформирована мощная база исследовательского флота, которая на сегодняшний день включает 8 крупнотоннажных, 10 среднетоннажных и 12 малотоннажных НИС, 244 единицы маломерных судов. Дополнительно к этому, благодаря выделенному в 2019 г. финансированию, подразделения ВНИРО были беспрецедентно оснащены техникой и оборудованием для проведения экспериментальных, лабораторных и экспедиционных исследований во всех областях рыбохозяйственной науки.