Перераспределение господдержки от строительства рыбоперерабатывающих заводов исключительно под постройку промыслового флота может привести к изъятию из оборота отрасли квот в объеме не менее 200 тыс. т. По словам президента Ассоциации рыбопромышленных предприятий Сахалинской области Максима Козлова, в настоящее время субъектами РФ обсуждается предложение ряда владельцев рыбопромыслового флота выделять на II этапе распределения инвестквот, который должен стартовать в 2022 году, водные биоресурсы только под строящиеся суда.